Osakonna vahetamine on mõeldud kaupade firmasiseseks üle kandmiseks ühest laoosakonnast teise. Osakonna vahetuse käigus kantakse üle kasutaja poolt soovitud kogus ning sellele kogusele vastav omasumma. Juhul kui laoarvestust peetakse partiide lõikes siis tuleb osakonna vahetuse käigus ära määrata ka partii, millest kaup võetakse ning millisesse ta pannakse.